Mars:Abaqus: Różnice pomiędzy wersjami
Z Komputery Dużej Mocy w ACK CYFRONET AGH
| Linia 25: | Linia 25: | ||
#!/bin/sh | #!/bin/sh | ||
#PBS -N abaqus_test | #PBS -N abaqus_test | ||
| − | #PBS -q | + | #PBS -q long |
#PBS -l mem=2gb | #PBS -l mem=2gb | ||
#PBS -l nodes=1:ppn=4 | #PBS -l nodes=1:ppn=4 | ||
| Linia 38: | Linia 38: | ||
np=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l) | np=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l) | ||
| − | # ustawianie | + | # ustawianie zadanej pamieci |
echo 'memory = "2 gb"' > abaqus_v6.env | echo 'memory = "2 gb"' > abaqus_v6.env | ||
| Linia 54: | Linia 54: | ||
#!/bin/sh | #!/bin/sh | ||
#PBS -N abaqus_test | #PBS -N abaqus_test | ||
| − | #PBS -q | + | #PBS -q long |
#PBS -l mem=6gb | #PBS -l mem=6gb | ||
#PBS -l nodes=4:ppn=2 | #PBS -l nodes=4:ppn=2 | ||
| Linia 64: | Linia 64: | ||
cd $PBS_O_WORKDIR | cd $PBS_O_WORKDIR | ||
| − | # ustawianie | + | # ustawianie zadanej pamieci i ewentualnie innych parametrow |
echo 'memory = "6 gb"' > abaqus_v6.env | echo 'memory = "6 gb"' > abaqus_v6.env | ||
Wersja z 07:44, 20 lut 2013
Spis treści
Informacje ogólne
Dostęp do wszystkich wersji Abaqusa uzyskuje się komendą:
module load Abaqus
Najnowszą zainstalowaną wersję 6.12-3 wywołuje się poleceniem:
abaqus ...
Pozostałe zainstalowane wersje można wywołać poleceniami:
Abaqus 6.11-2 - abq6112 ...
Abaqus 6.10EF1 - abq610ef1 ...
Abaqus 6.10-2 - abq6102 ...
Abaqus 6.9EF1 - abq69ef1 ....
Abaqus 6.8-3 - abq683 ...
Graficzne środowisko użytkownika uruchamiane jest poleceniem abaqus cae. Należy je uruchamiać jedynie na węźle obliczeniowym mars60, logując się na niego poleceniem ssh mars60 z węzła dostępowego. (Uwaga: należy pamiętać o przekierowaniu wyświetlania XWidnows).
Przegląd funkcji i poleceń dostępny zostanie wyświetlony po wykonaniu komendy abaqus help.
Przykładowe skrypty
Obliczenia w trybie wątków
#!/bin/sh
#PBS -N abaqus_test
#PBS -q long
#PBS -l mem=2gb
#PBS -l nodes=1:ppn=4
# ustawienie sciezek do pakietu Abaqus
module load Abaqus
# przejscie do katalogu, z ktorego wywolano skrypt PBS
cd $PBS_O_WORKDIR
# zliczenie zadanych procesorow
np=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)
# ustawianie zadanej pamieci
echo 'memory = "2 gb"' > abaqus_v6.env
input=plik_z_danymi_wejsciowymi
abaqus job=$input cpus=$np mp_mode=threads interactive
Zadanie Abaqusa będzie się wykonywać na jednym węźle i będzie wykorzystywało 4 procesory.
Oblicznia w trybie MPI
#!/bin/sh
#PBS -N abaqus_test
#PBS -q long
#PBS -l mem=6gb
#PBS -l nodes=4:ppn=2
# ustawienie sciezek do pakietu Abaqus
module load Abaqus
# przejscie do katalogu, z ktorego wywolano skrypt PBS
cd $PBS_O_WORKDIR
# ustawianie zadanej pamieci i ewentualnie innych parametrow
echo 'memory = "6 gb"' > abaqus_v6.env
# zliczenie zadanych procesorow
np=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)
input=plik_z_danymi_wejsciowymi
abaqus job=$input cpus=$np standard_parallel=all mp_mode=mpi interactive
Zadanie Abaqusa będzie się wykonywać na 4 węzłach i na każdym węźle będzie wykorzystywało 2 procesory
Dokumentacja online
http://baribal.cyf-kr.edu.pl:2080/
Dla wersji 6.12-3
http://mars.cyf-kr.edu.pl:2080/