Nag

Biblioteka NAG Library

NAG Library jest jedną z najpopularniejszych bibliotek podprogramów matematycznych. Pakiety biblioteki NAG obejmują m.in. następujące działy: algebrę, algebrę liniowa, interpolacje i aproksymacje, równania różniczkowe i całkowe, statystykę, programowanie liniowe, funkcje specjalne, badania operacyjne i sortowanie.

Na komputerze mars zainstalowane zostało następujące oprogramowanie firmy NAG:

• biblioteka NAG Fortran Library (FLL6I23DCL), Mark 23. Biblioteka zawiera procedury napisane w języku FORTRAN.
• biblioteka NAG Parallel Library (FDL6A03DP), Release 3. Biblioteka zawiera procedury zrównoleglone napisane w języku FORTRAN.
• biblioteka NAG C Library (CLL6I23DCL), Mark 23. Biblioteka zawiera procedury napisane w języku C.
• NAG Data Mining Components (DRL6A0DG), Release 2.0.
• NAG Toolbox for MATLAB (MBL6A23DML), Mark 22

Dodatkowe informacje o każdym z tych produktów i przykłady użycia zawierają notki informacyjne:

• man nag_fl - biblioteka NAG Fortran Library
• man nag_pl - biblioteka NAG Parallel Library
• man nag_cl - biblioteka NAG C Library
• man nag_dmc - NAG Data Mining Components
• man nag_matlab - NAG Toolbox for MATLAB

Sposób użycia NAG Fortan Library

Biblioteka rozprowadzana jest w 4 wersjach: statycznej i współdzielonej oraz korzystającej lub nie z biblioteki Intel Math Kernel Library (mkl).

• libnag_mkl.a - wersja statyczna, korzysta z biblioteki mkl
• libnag_mkl.so - wersja wspoldzielona, korzysta z biblioteki mkl
• libnag.a - wersja statyczna, nie korzysta z biblioteki mkl
• libnag.so - wersja współdzielona, nie korzysta z biblioteki mkl

Rekomendowane jest używanie biblioteki wykorzystującej Intel Math Kernel Library (mkl). Przed użyciem biblioteki, należy załadować odpowiednie moduły kompilatora i biblioteki:

 module load Intel/12.1
 module load NAG/Fl

i wywołać kompilator.

W zależności od tego jakiej biblioteki chcemy użyć, wywołanie wygląda następująco:

• dla wersji statycznej, korzystającej z biblioteki mkl

 ifort program.f90 -o program $flink_mkl

• dla wersji współdzielonej, korzystającej z biblioteki mkl

 ifort program.f90 -o program $flink_mkl_so

• dla wersji statycznej, nie korzystającej z biblioteki mkl

 ifort program.f90 -o program $flink

• dla wersji współdzielonej, nie korzystającej z biblioteki mkl

 ifort program.f90 -o program $flink_so

Sposób użycia NAG C Library

Biblioteka rozprowadzana jest w 4 wersjach: statycznej i współdzielonej oraz korzystającej lub nie z biblioteki Intel Math Kernel Library (mkl):

• libnagc_mkl.a - wersja statyczna, korzysta z biblioteki mkl
• libnagc_mkl.so - wersja współdzielona, korzysta z biblioteki mkl
• libnagc.a - wersja statyczna, nie korzysta z biblioteki mkl
• libnagc.so - wersja współdzielona, nie korzysta z biblioteki mkl

Rekomendowane jest używanie biblioteki wykorzystującej Intel Math Kernel Library (mkl). Przed użyciem biblioteki, należy załadować odpowiednie moduły kompilatora i biblioteki:

 module load Intel/12.1
 module load NAG/Cl

i wywołać kompilator.

W zależności od tego jakiej biblioteki chcemy użyć, wywołanie wygląda następująco:

• dla wersji statycznej, korzystającej z biblioteki mkl:

icc program.c -o program $clink_mkl

• dla wersji współdzielonej, korzystającej z biblioteki mkl

icc program.c -o program $clink_mkl_so

• dla wersji statycznej, nie korzystającej z biblioteki mkl:

icc program.c -o program $clink

• dla wersji współdzielonej, nie korzystającej z biblioteki mkl

icc program.c -o program $clink_so

W przypadku używania innego kompilatora, należy załadować tylko jeden moduŁ:

 module load NAG/Cl

i wywołać kompilator. Na przykład dla gcc można wykonać komendę:

 gcc program.c $gcclink_mkl_so

Sposób użycia NAG Parallel Library

Przed kompilacją ładujemy odpowiednie moduły:

 module load  NAG/Pl Intel/12.1

wywołujemy kompilator:

 mpiifort program.f -o program $nagmpilink $flslink $blaslink $syslink

a następnie wykonujemy program pod kontrola MPI:

 mpirun -np 4 program

Sposób użycia NAG Data Mining Components

Przed użyciem biblioteki, należy załadować odpowiedni moduł biblioteki:

 module load NAG/dmc

i wywołać kompilator:

 gcc program.c -o program $dmclink

Sposób użycia NAG Toolbox for MATLAB

Przed użyciem biblioteki, należy załadować odpowiedni moduł:

 module load NAG/matlab

a po wywołaniu programu MATLAB trzeba dodać ścieżkę do katalogu, w którym są zainstalowane podprogramy biblioteki NAG, komendą:

 >>addpath('/opt1/NAG/matlab/toolbox/NAG/mex.a64/','-end');

Konsultacje

Stefan Świąć, Dział Komputerów Dużej Mocy, email: s.swiac@cyfronet.pl

Lucyna Witkowska, Dział Oprogramowania, email: l.witkowska@cyfronet.pl