Prometheus:Lmod

Opis pakietu

Pakiet Lmod umożliwia łatwą i dynamiczną modyfikację zmiennych powłoki dostosowując ją do specyficznych wymagań danego pakietu oprogramowania. Dla każdego z pakietów oprogramowania dostępnego na klastrze zdefiniowano odpowiadający mu moduł (lub moduły, jeśli istnieje więcej niż jedna wersja danego pakietu). Nazwy modułów budowane są wg schematu nazwa-programu/wersja. W przypadku bibliotek schemat ma postać libs/nazwa-biblioteki/wersja, a dla programów narzędziowych (np. języki oprogramowania R lub Python) tools/nazwa-biblioteki/wersja. Zarówno dla pakietów oprogramowania jak i bibliotek najnowsza wersja jest domyślną, zatem ostatni człon wersja można pominąć. Zmian dokonuje się za pomocą komendy module i parametru określającego akcję.

Strona projektu: https://www.tacc.utexas.edu/research-development/tacc-projects/lmod

Dokumentacja projektu: https://www.tacc.utexas.edu/research-development/tacc-projects/lmod/user-guide oraz http://lmod.readthedocs.io/

Najczęściej wykorzystywane opcje:

• module add <moduł> lub module load <moduł> – załadowanie modułu danego programu
• module rm <moduł> lub module unload <moduł> – usunięcie modułu danego programu
• module list – wyświetlenie listy aktualnie załadowanych modułów
• module avail – wyświetla listę wszystkich dostępnych modułów
• module avail <nazwa_oprogramowania> – wyświetla listę wszystkich dostępnych wersji oprogramowania o nazwie nazwa_oprogramowania
• module purge – usunięcie wszystkich załadowanych modułów
• module show <moduł> lub module display <moduł> – wyświetl informacje nt. danego modułu
• module switch <moduł-1> <moduł-2> – wymiana modułów w powłoce
• module spider <tekst> – wyszukuje wszystkie moduły posiadające w nazwie określony tekst

Przykładowe użycie

• Załadowanie najnowszej wersji kompilatora Intel

module add compilers/intel

• Załadowanie kompilatora Intel w wersji 15.0.2

module add compilers/intel/15.0.2

• Wylistowanie wszystkich dostępnych wersji kompilatorów Intel

module avail compilers/intel

• Zamiana wersji 1.6.5 OpenMPI na wersję 1.8.4

module switch tools/openmpi/1.6.5-intel-15.0.2 tools/openmpi/1.8.4-intel-15.0.2

• Usunięcie ścieżek do kompilatora Intel w wersji 15.0.2 z środowiska

module rm compilers/intel/15.0.2

Wykorzystanie własnych modułów (Zaawansowane)

Pakiet Lmod umożliwia również tworzenie własnych modułów (TCL lub Lua). W tym celu należy wykonać polecenie module use /path/to/personal/modulefiles. Podana ścieżka określa katalog w którym użytkownik przetrzymuje własne moduły. Program lmod automatycznie sprawdzi nowe zainstalowane moduły i doda je do listy dostępnych. W modułach można wykorzystywać funkcje języków TCL lub Lua. Informacje jak tworzyć własne moduły znajdują się na w dokumentacji Lmod.

Uwagi

• Zaleca się ładować moduły jedynie w skryptach obliczeniowych, a nie w skryptach uruchamianych przy logowaniu na maszynę dostępową lub węzeł obliczeniowy. Dzięki temu łatwiej kontrolować środowisko uruchomieniowe oprogramowania, które ma zostać użyte oraz uniknąć konfliktów pomiędzy załadowanymi modułami.