Podstawy:SLURM vs PBS: Różnice pomiędzy wersjami

Wersja z 16:39, 8 gru 2017

Poniżej w tabeli znajduje się krótkie porównanie opcji oraz zmiennych systemowych pomiędzy systemami SLURM i PBS. Tabela może być pomocna dla osób przenoszących swoje skrypty pomiędzy tymi dwoma systemami kolejkowymi.

Spis treści

1 Dyrektywa systemu kolejkowego dla plików batchowych
2 Najważniejsze opcje oraz parametry
3 Najważniejsze zmienne systemowe
4 Najważniejsze komendy

Dyrektywa systemu kolejkowego dla plików batchowych

SLURM	PBS
`#SBATCH`	`#PBS`

Najważniejsze opcje oraz parametry

Opcja SLURM	Opcja PBS
`-N (--nodes=)`	`-l nodes=`
`--ntasks-per-node=`	`-l ppn=`
`--cpus-per-task=`	`-l ppn=`
`--mem-per-cpu=`	`-l pmem=`
`--mem=`	`-l mem=`
`-t (--time=)`	`-l walltime=`
`-p (--partition=)`	`-q`
`-o filename -e filename`	`-j oe`
`--mail-type=`	`-m`
`--mail=`	`-M`

Najważniejsze zmienne systemowe

Zmienna SLURM	Zmienna PBS
`SLURM_SUBMIT_DIR`	`PBS_O_WORKDIR`
`SLURM_NTASKS`	brak odpowiednika	brak odpowiednika	`PBS_NP`
`SLURM_JOB_ID`	`PBS_JOBID`
`SLURM_ARRAY_TASK_ID`	`PBS_ARRAYID`

Wartość PBS_NP możemy wyliczyć za pomocą SLURM_NTASKS * SLURM_CPUS_PER_TASK przy założeniu, że zadanie posiada więcej niż 1 rdzeń per proces. W innym przypadku PBS_NP jest równe SLURM_NTASKS.

Najważniejsze komendy

Komenda SLURM	Komenda PBS
`sbatch`	`qsub`
`squeue`	`qstat`
`scancel`	`qdel`

@@ Linia 42: / Linia 42: @@
 | <tt>SLURM_SUBMIT_DIR</tt> ||<tt>PBS_O_WORKDIR</tt>
 |-
-| <tt>SLURM_NTASKS</tt>|| <tt>PBS_NP</tt>
+| <tt>SLURM_NTASKS</tt>|| brak odpowiednika
+| brak odpowiednika || <tt>PBS_NP</tt>
 |-
 | <tt>SLURM_JOB_ID</tt> || <tt>PBS_JOBID</tt>
@@ Linia 48: / Linia 49: @@
 | <tt>SLURM_ARRAY_TASK_ID</tt> ||<tt>PBS_ARRAYID</tt>
 |}
+Wartość <tt>PBS_NP</tt> możemy wyliczyć za pomocą <tt>SLURM_NTASKS</tt> * <tt>SLURM_CPUS_PER_TASK</tt> przy założeniu, że zadanie posiada więcej niż 1 rdzeń per proces. W innym przypadku <tt>PBS_NP</tt> jest równe <tt>SLURM_NTASKS</tt>.
 ===Najważniejsze komendy===