Modules/Lmod

Opis pakietu

Pakiet Modules umożliwia łatwą i dynamiczną modyfikację zmiennych powłoki dostosowując ją do specyficznych wymagań danego pakietu oprogramowania. Dla każdego z pakietów oprogramowania dostępnego na klastrze zdefiniowano odpowiadający mu moduł (lub moduły, jeśli istnieje więcej niż jedna wersja danego pakietu). Nazwy modułów budowane są wg schematu nazwa-programu/wersja. W przypadku bibliotek schemat ma postać libs/nazwa-biblioteki/wersja, a dla programów narzędziowych (np. języki oprogramowania R lub Python) tools/nazwa-biblioteki/wersja. Zarówno dla pakietów oprogramowania jak i bibliotek najnowsza wersja jest domyślną, zatem ostatni człon wersja można pominąć. Zmian dokonuje się za pomocą komendy module i parametru określającego akcję.

Strona projektu: http://modules.sourceforge.net/ Dokumentacja projektu: http://modules.sourceforge.net/man/modulefile.html Inna dokumentacja: wersje źródłowe modułów lokalnych w /software/local/Modules

Najczęściej wykorzystywane opcje:

• module add <moduł> lub module load <moduł> – załadowanie modułu danego programu
• module rm <moduł> lub module unload <moduł> – usunięcie modułu danego programu
• module list – wyświetlenie listy aktualnie załadowanych modułów
• module avail – wyświetla listę wszystkich dostępnych modułów
• module avail <nazwa_oprogramowania> – wyświetla listę wszystkich dostępnych wersji oprogramowania o nazwie nazwa_oprogramowania
• module purge – usunięcie wszystkich załadowanych modułów
• module show <moduł> lub module display <moduł> – wyświetl informacje nt. danego modułu
• module switch <moduł-1> <moduł-2> – wymiana modułów w powłoce

Przykładowe użycie

• Załadowanie najnowszej wersji kompilatora Intel

module add intel

• Załadowanie kompilatora Intel w wersji 10.0

module add intel/10.0

• Wylistowanie wszystkich dostępnych wersji kompilatorów Intel

module avail intel

• Zamiana wersji Ethernet OpenMPI na wersję z Infiniband

module switch openmpi/1.4.3-intel-11.1-eth openmpi/1.4.3-intel-11.1-ib

• Usunięcie ścieżek do kompilatora Intel w wersji 10.0 z środowiska

module rm intel/10.0

Wykorzystanie własnych modułów (Zaawansowane)

Pakiet modules umożliwia również tworzenie własnych modułów. W tym celu należy załadować moduł use_own. Przy pierwszym załadowaniu modułu use_own zostanie założona w katalogu domowym użytkownika kartoteka privatemodules. W niej należy umieszczać własne moduły. Program modules automatycznie sprawdzi nowe zainstalowane moduły i doda je do listy dostępnych. W modułach można wykorzystywać funkcje języka TCL. Informacje jak tworzyć własne moduły znajdują się na stronie projektu.

Uwagi

Zaleca się ładować moduły jedynie w skryptach obliczeniowych, a nie w skryptach uruchamianych przy logowaniu na maszynę dostępową lub węzeł obliczeniowy. Dzięki temu łatwiej kontrolować środowisko uruchomieniowe oprogramowania, które ma zostać użyte oraz uniknąć konfliktów pomiędzy załadowanymi modułami.

Komenda modules avail <nazwa> znajduje jedynie moduły zaczynające się od ciągu znaków <nazwa> dlatego, jeżeli poszukuje się modułów zawierających gdziekolwiek ciąg <nazwa>, należy wykonać polecenie

module avail 2>&1 | grep <nazwa>