Zeus:TURBOMOLE: Różnice pomiędzy wersjami
(Utworzył nową stronę „{{DISPLAYTITLE:TURBOMOLE}} Na klastrze Zeus zainstalowano pakiet TURBOMOLE w wersjach 6.3.1, 6.4 oraz [[Zeus:...”) |
|||
| Linia 12: | Linia 12: | ||
Pakiet [[TURBOMOLE]] składa się z wielu skryptów obliczeniowych. Najważniejsze z nich to <tt>dscf</tt>, <tt>ridft</tt>, <tt>ricc2</tt>, <tt>grad</tt>, <tt>egrad</tt>, <tt>jobex</tt>, <tt>aoforce</tt>, <tt>aoforce</tt> oraz <tt>NumForce</tt>. Dodatkowo skrypty <tt>define</tt>, <tt>cosmoprep</tt> służą do przygotowania danych do obliczeń. | Pakiet [[TURBOMOLE]] składa się z wielu skryptów obliczeniowych. Najważniejsze z nich to <tt>dscf</tt>, <tt>ridft</tt>, <tt>ricc2</tt>, <tt>grad</tt>, <tt>egrad</tt>, <tt>jobex</tt>, <tt>aoforce</tt>, <tt>aoforce</tt> oraz <tt>NumForce</tt>. Dodatkowo skrypty <tt>define</tt>, <tt>cosmoprep</tt> służą do przygotowania danych do obliczeń. | ||
| − | '''Uwaga:''' Gdy obliczenia w [[TURBOMOLE]] | + | '''Uwaga:''' Gdy obliczenia w [[TURBOMOLE]] wymagają użycia dużej ilości przestrzeni dyskowej zaleca się by pliki tymczasowe tworzyć używając zasobu dyskowego [[Zeus:Lustre|Lustre]]. W przypadku wykorzystywania więcej niż jednego węzła obliczeniowego przechowywanie plików tymczasowych w systemie [[Zeus:Lustre|Lustre]] jest konieczne ponieważ katalog je zawierający musi być dostępny z wszystkich węzłów. |
Wersja z 08:28, 23 paź 2013
Na klastrze Zeus zainstalowano pakiet TURBOMOLE w wersjach 6.3.1, 6.4 oraz 6.5.
Informacje ogólne
Do ustawiania środowiska uruchomieniowego oprogramowania na klastrze Zeus służy narzędzie Modules. Dla oprogramowania TURBOMOLE przygotowano moduły apps/turbomole/<nazwa-wersji>, przy czym moduł apps/turbomole jest odnośnikiem dla wersji domyślnej. Do załadowania domyślnej wersji pakietu służy komenda:
module add apps/turbomole
Domyślna wersja to 6.5.
Pakiet TURBOMOLE składa się z wielu skryptów obliczeniowych. Najważniejsze z nich to dscf, ridft, ricc2, grad, egrad, jobex, aoforce, aoforce oraz NumForce. Dodatkowo skrypty define, cosmoprep służą do przygotowania danych do obliczeń.
Uwaga: Gdy obliczenia w TURBOMOLE wymagają użycia dużej ilości przestrzeni dyskowej zaleca się by pliki tymczasowe tworzyć używając zasobu dyskowego Lustre. W przypadku wykorzystywania więcej niż jednego węzła obliczeniowego przechowywanie plików tymczasowych w systemie Lustre jest konieczne ponieważ katalog je zawierający musi być dostępny z wszystkich węzłów.