Zeus:Mathematica: Różnice pomiędzy wersjami
| Linia 36: | Linia 36: | ||
==== Przykładowy skrypt ==== | ==== Przykładowy skrypt ==== | ||
===== Wersja szeregowa ===== | ===== Wersja szeregowa ===== | ||
| + | <syntaxhighlight lang="bash"> | ||
| + | #!/bin/env bash | ||
| + | ##### Maksymalna pamiec przydzielona dla zadania | ||
| + | #PBS -l mem=2gb | ||
| + | ##### 1 rdzen na 1 wezle | ||
| + | #PBS -l nodes=1:ppn=1 | ||
| + | ##### Maksymalny czas obliczen 1 godzina | ||
| + | #PBS -l walltime=3:00:00 | ||
| + | ##### Nazwa kolejki | ||
| + | #PBS -q l_short | ||
| + | ##### Nazwa zadania widoczna w systemie kolejkowym | ||
| + | #PBS -N nazwa_obliczen | ||
| + | ##### Nazwa grantu uzytego do obliczen | ||
| + | #PBS -A nazwa_grantu | ||
| + | # Ustawianie zmiennych srodowiskowych dla pakietu Mathematica przy uzyciu Modules | ||
| + | module add apps/mathematica/9.0.1 | ||
| + | |||
| + | # przejscie do sciezki, z ktorej wyslano zadanie do systemu kolejkowego | ||
| + | cd $PBS_O_WORKDIR | ||
| + | |||
| + | # uruchomienie zadania | ||
| + | math < skrypt.txt > wynik.txt | ||
| + | |||
| + | </syntaxhighlight> | ||
===== Wersja równoległa ===== | ===== Wersja równoległa ===== | ||
Aktualna wersja na dzień 06:37, 13 sie 2014
Wersje oprogramowania zainstalowane na klastrze Zeus.
Spis treści
Ograniczenia licencyjne - rejestracja użytkowników
W związku ze zmianą licencjonowania niektórych aplikacji udostępnianych przez ACK CYFRONET AGH, zmianie ulegają również sposoby dostępu do nich.
Użytkownicy, którzy założyli konta po 1.12.2012 r. muszą w celu uzyskania dostępu do pakietu Mathematica zarejestrować się w systemie licencji. Aby tego dokonać należy wysłać na adres m.czuchry[at]cyfronet.pl e-mail zawierający:
-tytuł wiadomości. UWAGA! Mailer automatycznie filtruje wiadomości, podany tytuł jest wymagany, inaczej wiadomość trafi nie tam, gdzie powinna i dostęp nie zostanie przyznany! Wymaganym tytułem jest: [NEW MATHEMATICA USER] -imie -nazwisko -instytucję (np. AGH, UJ, ...) -login -maszynę dostępową (np. zeus, mars, ...)
Użytkownicy zostaną na podstawie tych informacji zweryfikowani oraz dopisani do listy użytkowników mających dostęp do aplikacji.
Użytkownicy, którzy korzystali z pakietu Mathematica w od 01.01.2012 do 30.11.2012 zostaną dopisani automatycznie.
Informacje ogólne
Do ustawiania środowiska uruchomieniowego oprogramowania na klastrze Zeus służy narzędzie Modules.
Mathematica 9.0
Zmienne środowiskowe ustawiamy ładując moduł mathematica
module add apps/mathematica/9.0
Program uruchamiamy poleceniem
mathematica
Przykładowy skrypt
Wersja szeregowa
#!/bin/env bash
##### Maksymalna pamiec przydzielona dla zadania
#PBS -l mem=2gb
##### 1 rdzen na 1 wezle
#PBS -l nodes=1:ppn=1
##### Maksymalny czas obliczen 1 godzina
#PBS -l walltime=3:00:00
##### Nazwa kolejki
#PBS -q l_short
##### Nazwa zadania widoczna w systemie kolejkowym
#PBS -N nazwa_obliczen
##### Nazwa grantu uzytego do obliczen
#PBS -A nazwa_grantu
# Ustawianie zmiennych srodowiskowych dla pakietu Mathematica przy uzyciu Modules
module add apps/mathematica/9.0.1
# przejscie do sciezki, z ktorej wyslano zadanie do systemu kolejkowego
cd $PBS_O_WORKDIR
# uruchomienie zadania
math < skrypt.txt > wynik.txt