Mars:Abaqus

Na klastrze Mars zainstalowano pakiet Abaqus w wersji 6.11.

Informacje ogólne

Program uruchamiany jest poleceniem abaqus.

Graficzne środowisko użytkownika uruchamiane jest poleceniem abaqus cae. Należy je uruchamiać jedynie na węźle obliczeniowym mars60, logując się na niego poleceniem ssh mars60 z węzła dostępowego. (Uwaga: należy pamiętać o przekierowaniu wyświetlania XWidnows).

Przegląd funkcji i poleceń dostępny zostanie wyświetlony po wykonaniu komendy abaqus help.

Przykładowy skrypt

Wersja szeregowa

#!/bin/sh
#PBS -N abaqus_test
#PBS -q l_long
#PBS -l mem=2gb
#PBS -l nodes=1:ppn=1

# przejscie do katalogu, z ktorego wywolano skrypt PBS
cd $PBS_O_WORKDIR

# ustawianie dostepnej pamieci
echo 'memory = "2 gb"' > abaqus_v6.env  

input=plik_z_danymi_wejsciowymi

abaqus job=$input interactive

Wersja równoległa

#!/bin/sh
#PBS -N abaqus_test
#PBS -q l_long
#PBS -l mem=6gb
#PBS -l nodes=4:ppn=2

# przejscie do katalogu, z ktorego wywolano skrypt PBS
cd $PBS_O_WORKDIR

# ustawianie dostepnej pamieci
echo 'memory = "6 gb"' > abaqus_v6.env  
echo "mp_mpirun_path = {HP:'/opt1/abaqus/6.11-2/External/mpi/hpmpi-2.3/bin/mpirun'}" >> abaqus_v6.env

# zliczenie zadanych procesorow
np=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)

input=plik_z_danymi_wejsciowymi 

abaqus job=$input cpus=$np standard_parallel=all mp_mode=mpi interactive