Gromacs
Z Komputery Dużej Mocy w ACK CYFRONET AGH
Na klastrze Zeus zainstalowano pakiet Gromacs w wersjach 4.0.7-mkl-d, 4.0.7-mkl-s, 4.5.3-d oraz 4.5.3-s.
Spis treści
Informacje ogólne
Do ustawiania środowiska uruchomieniowego oprogramowania na klastrze Zeus służy narzędzie Modules. Pliki tymczasowe należy tworzyć używająć zasobu dyskowego Lustre. Dla oprogramowania Gromacs przygotowano moduły gromacs/<nazwa-wersji>, przy czym moduł gromacs jest odnośnikiem dla wersji domyślnej. Do załadowania domyślnej wersji pakietu służy komenda:
module add gromacs
Domyślna wersja to 4.5.3-s.
Program uruchamiamy poleceniem.