TURBOMOLE

Z Komputery Dużej Mocy w ACK CYFRONET AGH
Wersja z dnia 08:27, 23 paź 2013 autorstwa Noga (dyskusja | edycje) (Utworzył nową stronę „{{DISPLAYTITLE:TURBOMOLE}} Na klastrze Zeus zainstalowano pakiet TURBOMOLE w wersjach 6.3.1, 6.4 oraz [[Zeus:...”)
(różn.) ← poprzednia wersja | przejdź do aktualnej wersji (różn.) | następna wersja → (różn.)
Skocz do:nawigacja, szukaj

Na klastrze Zeus zainstalowano pakiet TURBOMOLE w wersjach 6.3.1, 6.4 oraz 6.5.

Informacje ogólne

Do ustawiania środowiska uruchomieniowego oprogramowania na klastrze Zeus służy narzędzie Modules. Dla oprogramowania TURBOMOLE przygotowano moduły apps/turbomole/<nazwa-wersji>, przy czym moduł apps/turbomole jest odnośnikiem dla wersji domyślnej. Do załadowania domyślnej wersji pakietu służy komenda:

 module add apps/turbomole

Domyślna wersja to 6.5.

Pakiet TURBOMOLE składa się z wielu skryptów obliczeniowych. Najważniejsze z nich to dscf, ridft, ricc2, grad, egrad, jobex, aoforce, aoforce oraz NumForce. Dodatkowo skrypty define, cosmoprep służą do przygotowania danych do obliczeń.

Uwaga: Gdy obliczenia w TURBOMOLE wymaga użycia dużej ilości przestrzeni dyskowej zaleca się pliki tymczasowe tworzyć używając zasobu dyskowego Lustre. W przypadku wykorzystywania więcej niż jednego węzła obliczeniowego przechowywanie plików tymczasowych w systemie Lustre jest konieczne ponieważ katalog je zawierający musi być dostępny z wszystkich węzłów.