Mars:Podstawy: Różnice pomiędzy wersjami

Aktualna wersja na dzień 13:03, 5 mar 2012

Spis treści

1 Nazwa maszyny dostępowej
2 Zasoby dyskowe
3 Dostępne oprogramowanie
4 Uruchamianie zadań
5 Opis kolejek
6 Zasady obowiązujące na komputerze Mars

Nazwa maszyny dostępowej

mars.cyf-kr.edu.pl

Możliwe są też kombinacje domen Cyfronetu: mars.cyfronet.pl, mars.cyfronet.krakow.pl)

Zasoby dyskowe

Lokalizacja	Limit	Przeznaczenie	Kopia bezpieczeństwa
/people/login	10GB	[katalog domowy użytkownika]	tak
/scratch/login	600GB	[przestrzeń dla plików tymczasowych zadań]	nie
/scratch-lustre/mars/login	brak limitu	[przestrzeń dla plików tymczasowych zadań]	nie

Dostępne oprogramowanie

Opis dostępnego oprogramowania znajduje się tutaj.

Uruchamianie zadań

System kolejkowy: Torque

Zarządca zasobów: Maui

W celu uruchomienia zadania niezbędna jest wiedza na temat podstawowych komend systemu kolejkowego. [link]

Opis kolejek

Nazwa kolejki	Maksymalna liczba zadań użytkownika	Maksymalny czas trwania zadania	Dodatkowe informacje
short	10	6h
long	5	200h
very_long	5	999h
accelrys	2	900h	wymagane uprawnienie

Zasady obowiązujące na komputerze Mars

 1. Każdy użytkownik posiada określoną "quota" w katalogu domowym /home (10GB)
    Ważne pliki należy umieszczać w katalogu domowym.
 2. Dostepne są dwa katalogi robocze
    a. /scratch o pojemności 2TB dostepny tylko na węzłach klastra Mars
    b. /scratch-lustre o pojemności 24TB dostępny dla klastra Mars i Zeus
 3. Dla każdego użytkownika utworzone są dwa katalogi:
       a. /scratch/login
       b. /scratch-lustre/mars/login
    w których może prowadzić obliczenia.
    Dla katalogu /scratch/login są ustawione dwa limity 'soft' na 50GB i 'hard' na 600GB
    Oznacza to, że użytkownik w czasie obliczeń może zająć do 600GB ale potem musi
    w ciagu 6 dni zejść poniżej 50GB aby można było przeprowadzać następne obliczenia.
 4. Pliki nieużywane i nie modyfikowane dłużej niż 3 m-ce będą z katalogu
    /scratch bezwzględnie usuwane bez ostrzeżenia w przypadku braku miejsca.
 5. Pliki Gau*.rwf po zakończeniu zadania będą usuwane z katalogu /scratch i /scratch-lustre/mars
    bez ostrzeżenia. Pliki z rozszeszeniem .rwf mające inną nazwę nie będą usuwane.
 6. Katalogi /home , /scratch i /scratch-lustre/mars są dostępne dla zadań kolejkowych PBSa 
    na wszystkich węzłach

@@ Linia 4: / Linia 4: @@
 <code>
-  zeus.cyfronet.pl
+  mars.cyf-kr.edu.pl
 </code>
-lub '''ui.cyfronet.pl''' (możliwe są też kombinacje domen Cyfronetu: '''zeus.cyf-kr.edu.pl''', '''zeus.cyfronet.krakow.pl''')
+Możliwe są też kombinacje domen Cyfronetu: '''mars.cyfronet.pl''', '''mars.cyfronet.krakow.pl''')
 == Zasoby dyskowe ==
@@ Linia 17: / Linia 17: @@
 ! Kopia bezpieczeństwa
 |-
-|/people/login || 5GB || [katalog domowy użytkownika] || tak
+|/people/login || 10GB || [katalog domowy użytkownika] || tak
 |-
-|/storage/login || 100GB || [składowanie danych użytkownika] || nie
+|/scratch/login || 600GB || [przestrzeń dla plików tymczasowych zadań] || nie
 |-
-|/mnt/lustre/scratch/login || brak limitu || [przestrzeń dla plików tymczasowych zadań] || nie
+|/scratch-lustre/mars/login || brak limitu || [przestrzeń dla plików tymczasowych zadań] || nie
 |}
@@ Linia 32: / Linia 32: @@
 System kolejkowy: Torque
-Zarządca zasobów: Moab
+Zarządca zasobów: Maui
 W celu uruchomienia zadania niezbędna jest wiedza na temat podstawowych komend systemu kolejkowego. [link]
@@ Linia 41: / Linia 41: @@
 ! Nazwa kolejki !! Maksymalna liczba zadań użytkownika !! Maksymalny czas trwania zadania !! Dodatkowe informacje
 |-
-| l_prio || 40 || 1 godzina || kolejka przeznaczona dla krótkich zadań, które powinny się szybko policzyć
+| short || 10 || 6h ||
 |-
-| l_test || 10 || 15 minut || kolejka do testów działania zadania
+| long || 5 || 200h ||
 |-
-| l_short || 1000 || 3 godziny ||
+| very_long || 5 || 999h ||
 |-
-| l_long || 700 || 3 doby ||
+| accelrys || 2 || 900h || wymagane uprawnienie
-|-
-| l_infinite || 700 || bez limitu ||
-|}
-== Opis właściwości węzłów obliczeniowych ==
-{| class="wikitable" style="text-align:center;"
-! Właściwość
-! Opis
-|-
-| mhz2666 || szybkość procesora
-|-
-| 16, 24gb || ilość pamięci RAM w serwerze obliczeniowym
-|-
-| core8, core12 || ilość rdzeni w serwerze obliczeniowym
-|-
-| ib_ql || sieć Inifniband firmy Qlogic
-|-
-|ib_mlx || sieć Infiniband firmy Mellanox
-|-
-|infiniband || serwer obliczeniowy z siecią Infiniband
 |}
-== Sposób korzystania z sieci Infiniband ==
+==Zasady obowiązujące na komputerze Mars==
-== Zasady obowiązujące na klastrze Zeus ==
-* Obowiązuje całkowity zakaz używania maszyny dostępowej do wykonywania obliczeń. Administratorzy będą przerywać takie procesy bez ostrzeżenia.
-* W celu skompilowania programu proszę użyć polecenia: <code>qsub -I -q l_interactive -l nodes=1:ppn=1</code><br/>Polecenie to spowoduje zalogowanie użytkownika na węzeł obliczeniowy, tam proszę uruchomić kompilację programu
-* W celu wykonywania obliczeń niezbędne jest podanie identyfikatora grantu za pomocą parametru "-A".
+. Każdy użytkownik posiada określoną "quota" w katalogu domowym /home (10GB)
-Szczegółowy opis grantów znajduje się [[Granty|tutaj]].
+     Ważne pliki należy umieszczać w katalogu domowym.
+. Dostepne są dwa katalogi robocze
+     a. /scratch o pojemności 2TB dostepny tylko na węzłach klastra Mars
+     b. /scratch-lustre o pojemności 24TB dostępny dla klastra Mars i Zeus
+. Dla każdego użytkownika utworzone są dwa katalogi:
+        a. /scratch/login
+        b. /scratch-lustre/mars/login
+     w których może prowadzić obliczenia.
+     Dla katalogu /scratch/login są ustawione dwa limity 'soft' na 50GB i 'hard' na 600GB
+     Oznacza to, że użytkownik w czasie obliczeń może zająć do 600GB ale potem musi
+     w ciagu 6 dni zejść poniżej 50GB aby można było przeprowadzać następne obliczenia.
+. Pliki nieużywane i nie modyfikowane dłużej niż 3 m-ce będą z katalogu
+     /scratch bezwzględnie usuwane bez ostrzeżenia w przypadku braku miejsca.
+. Pliki Gau*.rwf po zakończeniu zadania będą usuwane z katalogu /scratch i /scratch-lustre/mars
+     bez ostrzeżenia. Pliki z rozszeszeniem .rwf mające inną nazwę nie będą usuwane.
+. Katalogi /home , /scratch i /scratch-lustre/mars są dostępne dla zadań kolejkowych PBSa
+     na wszystkich węzłach