Zeus:Podstawy

Nazwa maszyny dostępowej

zeus.cyfronet.pl

lub ui.cyfronet.pl (możliwe są też kombinacje domen Cyfronetu: zeus.cyf-kr.edu.pl, zeus.cyfronet.krakow.pl)

Zasoby dyskowe

Lokalizacja	Limit	Przeznaczenie	Sposób dostępu	Kopia bezpieczeństwa	Możliwość wykonywania intensywnych zapisów i/lub odczytów	Uwagi
$HOME	7GB	katalog domowy użytkownika	NFS	tak	nie
$STORAGE	100GB	składowanie danych użytkownika	GPFS	nie	nie
$SCRATCH	brak limitu	przestrzeń dla plików tymczasowych zadań	Lustre	nie	tak	dane starsze niż 30 dni będą usuwane automatycznie
$PLG_GROUPS_SHARED/nazwa_zespołu $PLG_GROUPS_STORAGE/nazwa_zespołu	suma grantów	przestrzeń dla katalogów zespołów (PL-Grid)	Lustre	nie	nie

Dostępne oprogramowanie

Opis dostępnego oprogramowania znajduje się tutaj.

Uruchamianie zadań

System kolejkowy: Torque

Zarządca zasobów: Moab

W celu uruchomienia zadania niezbędna jest wiedza na temat podstawowych komend systemu kolejkowego.

Opis kolejek

Nazwa kolejki	Maksymalna liczba zadań użytkownika	Maksymalny czas trwania zadania	Maksymalna ilość rdzeni dla użytkownika	Dodatkowe informacje
l_test	3	15 minut	100	kolejka do testów działania zadania
l_prio	40	1 godzina	50	kolejka przeznaczona dla krótkich zadań, które powinny się szybko policzyć
l_short	1000	3 godziny	2048
l_long	500	2 tygodnie	2048
l_infinite	30	90 dni	2048
l_exclusive	700	2 tygodnie	2048	kolejka tylko dla zadan rownoległych z ppn=12
l_bigmem	-	1 tydzień	72	dostęp limitowany
l_interactive	3	72 godziny	72	kolejka do pracy interaktywnej
plgrid-testing	1	1 godzina	12
plgrid	700	72 godziny	1024
plgrid-long	1000	168 godzin	1024

Uwaga: Limity kolejek mogą zostać zmienione przez administratorów. Aktualne limity kolejek można sprawdzić komendą qstat -Q -f <nazwa_kolejki>

Opis właściwości węzłów obliczeniowych

Właściwość	Opis
E5645, X5650, opteron6276	model procesora
intel, amd	producent procesora
mhz2667	szybkość procesora
mem16gb, mem24gb	ilość pamięci RAM w serwerze obliczeniowym
core8, core12, core64	ilość rdzeni w serwerze obliczeniowym
ib_ql	sieć Inifniband firmy Qlogic
ib_mlx	sieć Infiniband firmy Mellanox
infiniband	serwer obliczeniowy z siecią Infiniband

Zasady obowiązujące na klastrze Zeus

• obliczenia wykonywane na maszynie dostępowej będą usuwane bez ostrzeżenia
• obliczenia z intensywnym wykorzystywaniem /people/[login] lub /storage/[login] będą usuwane bez ostrzeżenia
• obliczenia wykraczające poza zakres deklarowanego tematu badań zużywające znaczną część zasobów klastra będą usuwane bez ostrzeżenia
• uruchamianie benchmarków bez uprzedniego kontaktu z administratorami jest niedozwolone
• po pięciu nieudanych próbach zalogowania adres IP "atakującego" jest blokowany na 30 minut
• logowanie za pomocą kluczy SSH jest zablokowane
• prosimy uzywac oprogramowania ssh-agent do inicjalizacji kluczy z hasłem w celu połączenia z innymi maszynami
• prywatne klucze SSH nie posiadające haseł zabezpieczających będą usuwane bez ostrzeżenia
• w celu wykonywania obliczeń niezbędne jest podanie identyfikatora grantu za pomocą parametru "-A". Szczegółowy opis grantów znajduje się tutaj.
• w ramach grantu osobistego w jednym zadaniu można użyć 96 rdzeni obliczeniowych
• w celu skompilowania programu proszę użyć polecenia: qsub -I -q l_interactive -l nodes=1:ppn=1
  Polecenie to spowoduje zalogowanie użytkownika na węzeł obliczeniowy, tam proszę uruchomić kompilację programu