Ansys
Spis treści
Informacje ogólne
Dostęp do wersji Ansys 13.0 uzyskuje się komendą:
module load Ansys/13.0
Dostęp do wersji Ansys 14.0 uzyskuje się komendą:
module load Ansys/14.0
Graficzne środowisko Ansys dostępne jest na węźle mars60.
W tym celu należy zalogować się na ten węzeł komendą:
ssh mars60
i wykonać komendy:
module load Ansys/13.0 launcher130
lub
module load Ansys/14.0 launcher140
Środowisko graficzne Workbench otrzymamy wykonując komendę
runwb2
Uwaga: należy pamiętać o wcześniejszym uruchomieniu serwera X-ów na lokalnym PC). Dłuższe obliczenia należy uruchamiać w trybie batch-owym z węzła dostępowego mars
Ograniczenia licencyjne
Wersja | Ilość licencji | Typ licencji |
---|---|---|
wszystkie | 5 użytkowników | Academic Research |
Przykładowe skrypty
Obliczenia w trybie wątków
#!/bin/bash
#PBS -N ansys_test
#PBS -q long
#PBS -l nodes=1:ppn=6
# ustawienie sciezek do pakietu Ansys
module load Ansys/14.0
# przejscie do katalogu, z ktorego wywolano skrypt PBS
cd $PBS_O_WORKDIR
# utworzenie katalogu na pliki tymczasowe
mkdir $PBS_O_WORKDIR/tmp.$PBS_JOBID
# zliczenie zadanych procesorow
cpus=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)
input=plik_z_danymi_wejsciowymi
output=plik_z_wynikami
ansys140 -b -np $cpus -usessh -p aa_r -j nazwa_zadania -dir $PBS_O_WORKDIR/tmp.$PBS_JOBID -i $PBS_O_WORKDIR/$input -o $PBS_O_WORKDIR/$output
Powyższy skrypt uruchomi zadanie na jednym węźle i wykorzysta 6 procesorów do obliczeń. Dane wejściowe należy umieścić w katalogu z którego wstawia się zadanie do kolejki PBS. Wyniki obliczeń pojawią się w tym samym katalogu.
Obliczenia w trybie MPI
Użytkownik musi mieć możliwość łączenia się z innymi węzłami poprzez klucz. Zapewnia to jednorazowe wykonanie następujących komend:
ssh-keygen -t dsa
(odpowiedziec klawiszem Enter na wszystkie zapytania) a nastepnie
cd .ssh cp id_dsa.pub authorized_keys
oraz
cp /etc/ssh/ssh_known_hosts known_hosts
Wykonanie tych komend umożliwia komunikację między węzłami poprzez ssh bez konieczności podawania hasła.
#!/bin/bash
#PBS -N ansys_test
#PBS -q long
#PBS -l nodes=4:ppn=2
# ustawienie sciezek do pakietu Ansys
module load Ansys/14.0
# przejscie do katalogu, z ktorego wywolano skrypt PBS
cd $PBS_O_WORKDIR
# utworzenie katalogu na pliki tymczasowe
mkdir $PBS_O_WORKDIR/tmp.$PBS_JOBID
# zliczenie zadanych procesorow i wygenerowanie hosts
cpus=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)
ppn=$(($(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)/$(cat $PBS_NODEFILE | uniq|wc -l)))
hosts=`cat $PBS_NODEFILE|uniq|tr '\n' ':'|sed -e "s/:/:$ppn:/g"|sed -e 's/\:$//'`
input=plik_z_danymi_wejsciowymi
output=plik_z_wynikami
ansys140 -dis -b -np $cpus -usessh -p -machines $hosts aa_r -j nazwa_zadania -dir $PBS_O_WORKDIR/tmp.$PBS_JOBID -i $PBS_O_WORKDIR/$input -o $PBS_O_WORKDIR/$output
Powyższy skrypt uruchomi zadanie na czterech węzłach i wykorzysta po 2 procesory na każdym węźle do obliczeń. Dane wejściowe należy umieścić w katalogu z którego wstawia się zadanie do kolejki PBS. Wyniki obliczeń pojawią się w tym samym katalogu.