Zeus:Podstawy
Z Komputery Dużej Mocy w ACK CYFRONET AGH
Wersja z dnia 15:08, 15 paź 2020 autorstwa Admin (dyskusja | edycje) (→Zasady obowiązujące na klastrze Zeus)
Spis treści
Nazwa maszyny dostępowej
zeus.cyfronet.pl
lub ui.cyfronet.pl (możliwe są też kombinacje domen Cyfronetu: zeus.cyf-kr.edu.pl, zeus.cyfronet.krakow.pl)
Logowanie na maszynę dostępową możliwe jest poprzez SSH. Odciski palca (tzw. fingeprint) kluczy:
(RSA) SHA256:n5ro4MNw3Lmn1kr9SlnfBeFYSQ5u480kxAXMLDbyYnQ (RSA) MD5:d6:ca:74:0a:e5:64:2d:4d:64:ef:9b:c6:75:3c:88:2b
Proszę upewnić się, że został przedstawiony poprawny odcisk klucza.
Zasoby dyskowe
| Lokalizacja | Limit | Przeznaczenie | Sposób dostępu |
Kopia bezpieczeństwa |
Możliwość wykonywania intensywnych zapisów i/lub odczytów |
Uwagi |
|---|---|---|---|---|---|---|
| $HOME | 7GB | katalog domowy użytkownika | NFS | tak | nie | |
| $STORAGE | 100GB | składowanie danych użytkownika | GPFS | nie | nie | |
| $SCRATCH | brak limitu | przestrzeń dla plików tymczasowych zadań | Lustre | nie | tak | dane starsze niż 30 dni będą usuwane automatycznie |
| $PLG_GROUPS_SHARED/nazwa_zespołu $PLG_GROUPS_STORAGE/nazwa_zespołu |
suma grantów | przestrzeń dla katalogów zespołów (PL-Grid) | Lustre | nie | nie |
Użytkownik klastra może sprawdzić użycie przydzielonych mu zasobów dyskowych poleceniem zeus-fs.
Dostępne oprogramowanie
Opis dostępnego oprogramowania znajduje się tutaj.
Uruchamianie zadań
System kolejkowy: SLURM
W celu uruchomienia zadania niezbędna jest wiedza na temat podstawowych komend systemu kolejkowego.
Opis partycji
| Nazwa partycji | Maksymalny czas trwania zadania |
Dodatkowe informacje |
|---|---|---|
| plgrid-testing | 1 godzina | zwiększony priorytet przeznaczona na krótkie zadania testowe, kompilację kodu, kopiowanie danych |
| plgrid | 72 godziny | partycja domyślna, ustawiana automatycznie przy braku wyboru partycji |
| plgrid-short | 3 godziny | |
| plgrid-long | 168 godzin | partycja pozwalająca na zlecanie zadań z długim czasem wykonania |
| plgrid-gpu | 72 godziny | partycja zawierająca węzły GPGPU |
Uwaga: Limity kolejek mogą zostać zmienione przez administratorów. Aktualne limity kolejek można sprawdzić komendą scontrol show partition=<nazwa_partycji>
Opis właściwości węzłów obliczeniowych
| Właściwość | Opis |
|---|---|
| E5645, X5650, opteron6276 | model procesora |
| intel, amd | producent procesora |
| mhz2667 | szybkość procesora |
| mem16gb, mem24gb | ilość pamięci RAM w serwerze obliczeniowym |
| core8, core12, core64 | ilość rdzeni w serwerze obliczeniowym |
| ib_ql | sieć Inifniband firmy Qlogic |
| ib_mlx | sieć Infiniband firmy Mellanox |
| infiniband | serwer obliczeniowy z siecią Infiniband |
Zasady obowiązujące na klastrze Zeus
- obliczenia wykonywane na maszynie dostępowej będą usuwane bez ostrzeżenia
- obliczenia z intensywnym wykorzystywaniem /people/[login] lub /storage/[login] będą usuwane bez ostrzeżenia
- obliczenia wykraczające poza zakres deklarowanego tematu badań zużywające znaczną część zasobów klastra będą usuwane bez ostrzeżenia
- uruchamianie benchmarków bez uprzedniego kontaktu z administratorami jest niedozwolone
- po pięciu nieudanych próbach zalogowania adres IP "atakującego" jest blokowany na 30 minut
- prosimy uzywac oprogramowania ssh-agent do inicjalizacji kluczy z hasłem w celu połączenia z innymi maszynami
- prywatne klucze SSH nie posiadające haseł zabezpieczających będą usuwane bez ostrzeżenia
- w celu wykonywania obliczeń niezbędne jest podanie identyfikatora grantu za pomocą parametru "-A". Szczegółowy opis grantów znajduje się tutaj.
- w ramach grantu osobistego w jednym zadaniu można użyć 96 rdzeni obliczeniowych
- w celu skompilowania programu proszę użyć zadań interaktywnych.