NAMD

Z Komputery Dużej Mocy w ACK CYFRONET AGH
Wersja z dnia 09:20, 8 lis 2012 autorstwa Maciej (dyskusja | edycje) (dodanie informacji o wymaganym infinibandzie)
(różn.) ← poprzednia wersja | przejdź do aktualnej wersji (różn.) | następna wersja → (różn.)
Skocz do:nawigacja, szukaj

Opis aplikacji

NAMD (NAnoscale Molecular Dynamics) jest to pakiet do symulacji dynamiki molekularnej metodami MM.

ABY UŻYWAĆ NAMD NA KLASTRZE ZEUS NALEŻY WYSPECYFIKOWAĆ DOSTĘP DO INFINIBAND POPRZEZ KOMENDĘ PBS infiniband, np.: -l nodes=2:ppn=2:infiniband

Strona producenta: http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd
Dokumentacja producenta: http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.8/ug/
Inna dokumentacja:

Wersje na maszynach Cyfronetu

Baribal Panda Mars Zeus Zeus GPGPU Zeus vSMP
2.7b2

Ograniczenia licencyjne

Wersja Ilość licencji Typ licencji
- - -

Zalecenia ogólne

Sposób uruchamiania

Zeus Mars

Źródło: „https://kdm.cyfronet.pl/mediawiki/index.php?title=NAMD&oldid=1109”