NAMD

Z Komputery Dużej Mocy w ACK CYFRONET AGH
Skocz do:nawigacja, szukaj

Opis aplikacji

NAMD (NAnoscale Molecular Dynamics) jest to pakiet do symulacji dynamiki molekularnej metodami MM.

ABY UŻYWAĆ NAMD NA KLASTRZE ZEUS NALEŻY WYSPECYFIKOWAĆ DOSTĘP DO INFINIBAND POPRZEZ KOMENDĘ PBS infiniband, np.: -l nodes=2:ppn=2:infiniband

Strona producenta: http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd
Dokumentacja producenta: http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.8/ug/
Inna dokumentacja:

Wersje na maszynach Cyfronetu

Baribal Panda Mars Zeus Zeus GPGPU Zeus vSMP
2.7b2

Ograniczenia licencyjne

Wersja Ilość licencji Typ licencji
- - -

Zalecenia ogólne

Sposób uruchamiania

Zeus Mars